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凝胶染料  分子生物学

凝胶染料 分子生物学

简要描述:

凝胶染料 分子生物学 ,SYBR Green II是目前已知电泳凝胶中RNA检测较灵敏的染料之一,在琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶中低检到100pg RNA或ssDNA的单一条带(使用254nm紫外反射光源照射,并用宝丽来667黑白胶片和SYBR滤光片拍照)

产品时间:2024-03-20

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SYBR Green II RNA Gel Stain (10,000× in DMSO)

RNA凝胶染料

 

 

产品标签

SYBR Green IIGoldViewAcridine Orange 吖啶橙GelRed; GelGreen;溴化乙锭(EB)SYBR Green I

 

产品信息

产品名称

产品编号

规格

价格(元)

SYBR Green II RNA Gel Stain (10,000× in DMSO) RNA凝胶染料

MF0752-100UL

100µl

780

SYBR Green II RNA Gel Stain (10,000× in DMSO) RNA凝胶染料

MF0752-500UL

500µl

2950

 

产品描述

SYBR Green II是目前已知电泳凝胶RNA检测较灵敏的染料之一,在琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶中低检到100pg RNA或ssDNA的单一条带(使用254nm紫外反射光源照射,并用宝丽来667黑白胶片和SYBR滤光片拍照)。即使用300nm透射光也能检测到500pg RNA的单一条带。SYBR Green II的灵敏度明显强于溴化乙啶(EB)。标准琼脂糖迷你胶EB低检出1.5ng单链核酸的单一条带(使用300nm透射光照射并用橙-红明胶滤光片拍照)。

SYBR Green II在变性琼脂糖/甲醛凝胶和聚丙烯酰胺/尿素凝胶中的检测灵敏度有点降低,然而仍优于EB。为了获得大的检测灵敏度,琼脂糖/甲醛凝胶必须在EB染色前清洗数小时。相反,不做任何的清洗或脱色步骤,用SYBR Green II染色的琼脂糖/甲醛凝胶或聚丙烯酰胺/尿素凝胶能检测到1ng RNA单一条带(254nm反射照明)和4ng RNA单一条带(300nm透射照明)。SYBR Green II在RNA检测具备这一灵敏度的特性归因于几个因素,包括*的荧光量子产量、结合能力和荧光增强。

本品溶于DMSO 10,000×的SYBR Green II RNA核酸染料,可用于:1)Northern Blot、起始位点作图或cDNA制备前对RNA产物的小量分析;2)高分辨率变性梯度凝胶电泳(DGGE)后对5rRNA迁移方式的观察;3)单链构象多态性(SSCP)中的DNA染色;4)PCR扩增前对DNA染色。

 

注意事项

  • 必须警告用户注意,目前尚无关于SYBR Green II 对人体的致突变性或毒性的数据。由于该染料与核酸结合,应当被看作潜在诱变剂,使用时要小心谨慎。在处理DMSO储存液时应特别小心,因DMSO能促进有机分子进入组织。强烈建议处理DMO储存液需戴双层手套。和所有的核酸染料一样,含SYBR Green II RNA核酸染料的溶液需先穿过活性炭再丢弃。活性炭之后必须焚烧来破坏染料。
  • SYBR Green II可通过乙醇沉淀法从核酸中去除。异丙醇沉淀法去除效果稍差些。正丁醇萃取、氯萃防取和酚萃取法无法有效去除染料。
  • 先用EB染色的凝胶可接下来用SYBR Green II染色,根据电泳后染色(post-staining)的标准步骤操作。与直接用SYBR Green II染色相比较可能灵敏度有些降低。
  • 不要在玻璃器皿中稀释SYBR Green II储存液,因其会结合到玻璃上。在聚丙烯器皿中稀释储存液。
  • SYBR Green II不会干扰酶反应。
  • 当用SYBR Green II染Northern或Southern Blot凝胶,建议在预杂交液和杂交液内加入0.1%-0.3% SDS
  • 不建议用254nm紫外透射仪对凝胶拍照,因紫外光源的轮廓会出现在照片上。需要使用允许525nm光透过且排斥其他波长光的滤光片。
  • 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
  • 光谱特征

SYBR Green II RNA核酸染料可用常见的紫外反射和透射激发光源,以及手持式紫外灯检测。SYBR Green II大激发波长为497nm,但还有一个二级激发峰集中在254nm附近。与RNA结合的SYBR Green II的荧光发射集中在520nm。这些光谱特性让SYBR Green II适用于多种凝胶检测仪,从紫外反射(上紫外)和透射仪(下紫外)到氩离子激光器和水银灯激发的凝胶扫描仪。

 

使用方法

一、使用前准备工作

使用前将本品取出并回温至室温,使DMSO*解冻、溶液均一。于离心机上短暂离心确保所有溶液管底。*次使用时可将本品分装成多个小份后冻存,小份染料能更溶解

 

、 染色方法

1电泳后染色(后染,推荐)

2电泳前染色(预染)

 

、 观察和凝胶成像

3.1 使用300nm紫外透射或254nm紫外反射光(灵敏度更高)照射染色凝胶。

3.2 为了加灵敏度,建议使用黑白胶片,可用的SYBR Green照相滤光片(Thermo fisher#S7569)拍照。许多其他的黄色或绿色明胶或玻璃纸滤光片也能用来拍照,但绝大多数可能会减低灵敏度。EB染色凝胶拍照用的橙-红滤光片不适合于SYBR Green II染色凝胶。

3.3 用的SYBR Green照相滤光片(Thermo fisher#S-7569)和Polaroid 667黑白胶片对凝胶进行拍照。染色凝胶基本无背景荧光,当检测少量RNA,允许长期胶片曝光。对于300nm透射,通常F-stop设置4.5时曝光1-2s足够。对于254nm反射(特别是手持灯),大约需要曝光1-1.5min以得到大灵敏度。

 

相关产品

货号

名称

规格

MF0751-100UL

SYBR Green I Nucleic Acid Gel Stain  (10,000× in DMSO)  核酸凝胶染料

100µl

MF0752-100UL

SYBR Green II RNA Gel Stain (10,000× in DMSO) RNA凝胶染料

100µl

MF0753-1ML

GoldView Nucleic Acid Gel Stain (10,000×) 核酸染料(10,000×)

1ml

MF0754-500UL

MKRed Nucleic Acid Gel Stain (10,000× in Water) 核酸凝胶染料(效果同GelRed)

500µl

MF0755-500UL

MKGreen Nucleic Acid Gel Stain (10,000× in Water) 核酸凝胶染料(效果同GelGreen)

500µl

MF0756-1G

Ethidium Bromide (EB) 溴化乙锭(EB,粉末)

1g

 

 

 — —Written/Edited by V. Shallan【版权归MKBio懋康所有】

 

 

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SYBR Green II RNA Gel Stain (10,000× in DMSO) RNA凝胶染料 分子生物学

SYBR Green II RNA Gel Stain (10,000× in DMSO) RNA凝胶染料 分子生物学

 

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